В Санкт-Петербурге зима 1907 года оказалась особенно холодной. С декабря у Д. И. Менделеева была острая форма гриппа. Несмотря на это, он пошел в Главную палату мер и весов, так как министр торговли и промышленности собирался совершить запланированный на этот день визит.

Это было плохое решение, которое привело к дальнейшему ухудшению здоровья Дмитрия Ивановича. Вскоре после этого, 2 февраля 1907 года, Менделеев скончался в своем доме.

100 лет спустя Испания отметила Год науки большим количеством мероприятий и выбрала великое наследие – Периодическую таблицу Менделеева – в качестве официального образа мероприятий, организованных в целях повышения осведомленности общественности и продвижения химии.
Испания отпраздновала 2007 год, объявленный в стране Годом науки, чествованием Д. И. Менделеева.
Таблицей Менделеева был украшен фасад Технологического университета.
В стране были выпущены почтовые марки с абстрактным изображением Периодической системы.